ההרשמה למועמדים חדשים ולתלמידים ותיקים המבקשים להוסיף/להחליף חוג לימודים ולהתחיל בלימודי שנה א' בפקולטה, מתקיימת באמצעות המדור לרשום וקבלה (למועמדים בעלי תעודת בגרות ישראלית) ובאמצעות המדור לרשום וקבלה -חו"ל (למועמדים מחו"ל) - במועדים המפורסמים על ידי משרדים אלה.

מועמדים ותיקים מהאוניברסיטה העברית המבקשים להוסיף/להחליף חוג לימודים משנה ב' ומעלה בפקולטה למדעי הטבע, חייבים להירשם לחוג החדש במדור לרשום וקבלה  ובנוסף עליהם להגיש בקשה במזכירות הפקולטה. מועמדים ממוסדות אחרים להשכלה גבוהה מהארץ או מחו"ל המבקשים להתקבל ללימודים משנה ב' ומעלה חייבים להירשם  במדור לרישום וקבלה, באגף למינהל תלמידים. 

מידע מפורט על סדרי הרשמה, מועדי הגשת בקשות ותנאי קבלה מופיע ב"מדריך לנרשם" המתפרסם סמוך למועד פתיחת ההרשמה (חודש ינואר). המדריך מתפרסם באתר האינטרנט האוניברסיטאי http://info.huji.ac.il .